Phylo The DNA Puzzle Game (el puzzle del ADN)

PhyloGame

La comparación de los genomas de varias especies es una de las técnicas más fundamentales y poderosas para la biología molecular. Nos ayuda a descifrar nuestro ADN e identificar nuevos genes. Aunque parezca solo un juego, Phylo es en realidad un marco para aprovechar el poder de cómputo de la humanidad para resolver el problema de la Alineación de Secuencias Múltiples.

¿Qué es una alineación de secuencia múltiple?

Una alineación de secuencia es una forma de organizar las secuencias de D.N.A, R.N.A o proteína para identificar regiones que presenten similitudes. Estas similitudes pueden ser consecuencias de relaciones funcionales, estructurales o evolutivas entre las secuencias. A partir de tal alineación, los biólogos pueden inferir orígenes evolutivos compartidos, identificar sitios funcionalmente importantes e ilustrar eventos de mutación. Más importante aún, los biólogos pueden rastrear la fuente de ciertas enfermedades genéticas.

El problema

Tradicionalmente, los algoritmos de alineación de secuencias múltiples utilizan heurísticas computacionalmente complejas para alinear las secuencias. Desafortunadamente, el uso de heurísticas no garantiza la optimización global, ya que sería prohibitivo computacionalmente costoso lograr una alineación óptima. Esto se debe en parte al tamaño total del genoma, que consta de aproximadamente tres mil millones de pares de bases, y al aumento de la complejidad computacional que resulta de cada secuencia adicional en una alineación.

Cada alineación se recibe, analiza y almacena en una base de datos, donde finalmente se volverá a introducir en la alineación global como una optimización.

Se juega en la siguiente dirección:

https://phylo.cs.mcgill.ca/play.html

Code Fred: Survival Mode

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Code Fred es un juego para conocer mejor nuestro organismo.

¿Alguna vez te has detenido a pensar en lo que te mantiene respirando, cómo la información pasa de tus sentidos a tu cerebro al instante, o cualquiera de las otras cosas asombrosas que suceden constantemente para mantenerte vivo? Ahora puedes saltar dentro del cuerpo humano y participar en estos procesos fisiológicos para ayudar a Fred a superar el peligro en el bosque.

Code Fred: Survival Mode es un juego del Museo de Ciencia e Industria de Chicago sobre la asombrosa complejidad del cuerpo humano. Los objetivos de aprendizaje del juego son comprender cómo funcionan los sistemas corporales individuales participando en procesos fisiológicos y mostrar cómo todos los sistemas corporales están interconectados y son interdependientes. En Code Fred los jugadores ayudan a un personaje a huir de un lobo saltando dentro de su cuerpo para jugar una serie de minijuegos. Cada uno de estos mini juegos trata con un proceso fisiológico diferente e involucra múltiples sistemas corporales. Por ejemplo, los jugadores pueden enviar adrenalina a órganos clave para ayudar a Fred a correr más rápido, o aumentar la frecuencia cardíaca para hacer circular más oxígeno a los músculos. Completar cada desafío ayuda a Fred a correr un poco más lejos y te da más tiempo para jugar.

Pierde cualquier desafío, y Fred muere.

Glups.

https://www.msichicago.org/play/codefred/

Disaster Detector

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En este juego los participantes han de ayudar a los habitantes de la ciudad de Smithsonville -y también de otras ciudades- a predecir y a prepararse para afrontar posibles desastres naturales. El jugador habrá de utilizar todas las herramientas disponibles para efectuar predicciones y salvar así la ciudad de los posibles daños ayudando a los ciudadanos a prepararse adecuadamente.

El Detector de desastres enseña a los jugadores cómo analizar e interpretar los datos sobre peligros naturales con el objetivo de pronosticar y prevenir situaciones catastróficas futuras y también cómo implementar medidas para mitigar los efectos de esos desastres.

Este juego fue financiado por el programa Investing in Innovation (i3) validation grant (U396B100097) concedido al Smithsonian Science Education Center (SSEC) por el Departamento de Educación de los Estados Unidos.

Se puede jugar de forma gratuita y libre desde la siguiente web:

https://ssec.si.edu/disaster-detector

Crescent Loom

CresLoom

Crescent Loom es un juego que propone el diseño de un modelo interactivo para los circuitos neuronales. Los jugadores han de construir criaturas submarinas basándose en conceptos físicos y diseñar sus cerebros para después resolver una serie de rompecabezas y explorar un ecosistema extraño.

Los jugadores tienen a su disposición una especie de caja de herramientas que les servirá para crear cuerpos básicos con circuitos neuronales. Luego se les presentará una serie de desafíos que tendrán que resolver con los fundamentos de cómo funciona el cerebro.

Crescent Loom tiene la intención de demostrar que algunos de los conceptos centrales de los circuitos neuronales son cuestiones con las que se puede comprender y jugar.

Se puede jugar en la siguiente dirección:

http://wick.works/crescentloom/

Comet Quest

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Comet Quest es un juego del NASA SpacePlace en el que el jugador ha de conducir una sonda para aterrizar en un cometa y tomar muestras de su superficie.

El juego encomienda 5 responsabilidades al jugador:

  1. Llegar al núcleo del cometa y lanzar un módulo de aterrizaje en una zona de interés científico.

    Pantalla del juego que muestra el núcleo del cometa con la sonda Rosetta y el espiral que el módulo de aterrizaje seguirá cuando sea lanzado de la nave espacial.

  2. Observar aspectos científicos interesantes desde el módulo de aterrizaje y la sonda espacial.
  3. Recibir datos desde el módulo de aterrizaje.
  4. Transmitir los datos del orbitador y del módulo de aterrizaje hacia la Tierra.
  5. Evitar que Rosetta choque contra piezas grandes de materiales del cometa que se desprenden de la superficie.

    Pantalla del juego con muchos acontecimientos a la vez.

Ánimo.

Se puede jugar desde la siguiente dirección:

https://spaceplace.nasa.gov/comet-quest/sp/

Audubon’s Mission Migration Game

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Es este un juego sobre migraciones, en este caso de aves. En este juego el jugador intentará ayudar a que su bandada migre de manera segura, aprendiendo cómo las decisiones que se toman cada día en el hogar, escuela y vecindario pueden afectar el destino de estas aves migratorias, tanto de manera positiva como negativa. Al finalizar el juego, se habrán adquirido algunos conocimientos más para ayudar a las aves a prosperar y sobrevivir en sus diferentes hogares y también en su viaje.

Resultado de imagen de Audubon's Mission Migration Game

En la primavera y el otoño, muchas aves vuelan largas distancias en busca de comida, agua, refugio y espacio: las cosas básicas que necesitan para sobrevivir. A lo largo de estas rutas, se encuentran con muchos tipos diferentes de hábitats, desde el campo y el bosque hasta los barrios y las grandes ciudades, y, a veces, se enfrentarán a peligros tanto naturales como provocados por el hombre.

Se puede jugar desde la siguiente dirección:

https://www.audubon.org/play-audubons-mission-migration-game

Cell to Singularity

cell to singularity

Érase una vez, hace más de 4.500 millones de años, un Sistema Solar sin vida. Y luego, casi en un abrir y cerrar de ojos en la escala de tiempo geológico, todo cambió. En lo profundo de la sopa primordial en la Tierra se encuentran los compuestos orgánicos que darían origen a los humildes orígenes de la vida. Solo es preciso alguien que ponga esto en marcha…

Cell to Singularity es un juego de evolución en el que se adquiere la capacidad de generar vida, partiendo desde un organismo unicelular hasta los organismos multicelulares más complejos: peces, reptiles, mamíferos, monos, humanos… y más allá.

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Dotado de un espectro gráfico muy desarrollado, el juego permite progresar de una forma muy imaginativa y sorprendente, pudiendo pasar de actualizar la evolución de un organismo de una sola célula hasta alcanzar una civilización al borde de un colapso ambiental y tecnológico obligada a explorar la posibilidad de sobrevivir en Marte.

Se puede jugar gratuitamente desde la siguiente dirección:

http://www.celltosingularity.com/